从时间上说，刘黑闼不是最后被消灭的，但刘黑闼却可以算是李唐立国的最后一个障碍。此后的辅公祏、梁师都等人都只是唐平定天下的余波，但这个真正的余波反倒更有威胁。说刘黑闼是余波，是因为他并非在隋末起兵成为反王，而是在窦建德失败后其余部共同叛乱推举了他作首领。
隋末刘黑闼辗转了几次，终于在被李世勣生擒之后，作为俘虏献给了窦建德。由于过去是朋友，窦建德立即任用他为将军。窦建德失败之后，刘黑闼像其他没被杀掉的人一样，解甲归田了。
然而打败王、窦之后，唐军乃至唐廷的政策都比较怪。一般情况下李世民并不杀很多人，然而攻下洛阳之后，他却杀了一批洛阳的将军，如段达、杨公卿、朱粲、单雄信……其朱粲是吃人魔王天怒人怨实在该杀（朱粲死后，很多积怨甚久的百姓向他的尸体抛掷砖瓦，按书上的话就是须臾若冢，可见杀他实在是快人心），而对单雄信按说一向不计前嫌的李世民也不会计较，若是解释为怕他反覆无常倒也还过得去，但是其他人就没有必杀的理由了。或许是李渊的密令？此前李渊也曾对宇文士及有过归语尔王：今取洛阳，止欲息兵。克城之日，乘舆法物，图籍器械，非私家所须者，委汝收之。其余子女玉帛，并以分赐将士的口头诏令，但这里只是提了物品图籍和子女玉帛的分配方式，并未涉及到战后俘虏的问题，应当是另有吩咐吧。否则以李世民一惯的作风，实难理解为什么要非杀不可，但这倒是很符合李渊的风格。李世民将王、窦等人献俘之后，李渊又下令要窦建德的将军们到长安来，这便惊动了他们，使窦的旧部以为李渊要举清洗——事实上只怕也真是如此。李渊这样做自有他的考虑，如果他们真来的话，那么自然不费吹灰之力就可以杀掉了；如果不来的话，那必然会谋反，这样就可以用正光明的理由派军剿灭。总之，无论怎么个杀法，都无疑会达到斩草除根的目的。唐初河北（河北不是今天我们说的河北省，而是比河北省要得多的地区，就好比王维《九月九日忆山东兄弟》的兄弟们并不是在山东省一样）一直是李唐不控制得来的地区，这一方面和家族之类的有关（后来唐修族谱，便要刻意降低山东士族的身份，而提高关陇贵族的地位），另一方面，也和窦建德实在太得人心有关，直至后来河北都有人祭祀窦建德。因此如果能借机将窦的余部一网打尽无疑是最让李渊省心的方法了。
既然如此，那么窦的余部就不客气地选择了后者。刘黑闼正是在这种情况下，担任了起兵的首领。说来这也和占卜有关，隋末不是流行了好一阵李氏将兴吗，窦的旧部占卜时占出来应立刘姓之人，所以想到了刘黑闼。刘黑闼一听说要起兵为窦建德报仇，十分高兴，杀掉了牦牛和家一起饱餐了一顿。刚开始只有百余人，竟然袭破了一个县，可见这支队伍从一开始就不同凡响。此后又渐渐发展，人数也越来越多，唐的几个刺史都不是刘黑闼的对手。
那么朝廷此时就要插手了，李渊派李神通去平定。李神通曾经败在窦建德的手，李渊这次让他去平定刘黑闼很可能是想给他一次复仇挣回面子的机会，要说李渊对自己的宗室真不是一般的好，可惜李神通实在有点不争气，但也不能全怪他，因为刘黑闼实在是难对付。那么可想而知，李神通又被打得败，而且是和李艺一起败的。李艺此前对付窦建德还是有一套的，但对付刘黑闼就对付不过来了。打到宗城的时候，刘黑闼碰到了一个老朋友——李世勣。当初就是李世勣把刘黑闼送到了窦建德那里。上一次是李世勣获胜，而这一次却是他的惨败：步卒五千人，皆殁于阵，世勣与武通仅以身免（很是奇怪，那时好像很多全军覆没的战斗，主帅却能仅以身免）。李世民一定十分后悔，当初怎么就没杀了他呢？
刘黑闼的起兵使李渊终于认识到了河北实力的雄厚，并不是一个李神通就能应付的。这时李世民请战，恐怕他不请战李渊也得派他去了。总之，是李世民军一到，就挫败了刘黑闼的几次进攻——注意，也只是挫败而已。这使得两人都必须重新估量一下对手，李世民还好说，看刘黑闼一上来的几次挑战，显然是低估了李世民。
就在对付刘黑闼的时候，唐军损失了一员将，即罗士信。他应该就是后来说罗成的原型了吧，只不过在演义罗成是在李建成、李元吉手下被逼上阵战死的，而真正的罗士信却是在李世民手下为了守洺水而死。本来若说战阵之间的勇武，罗士信并没有输，但是困守在吸引着刘军主力的孤城，罗士信当然不好过，不巧的是，天降雪，打乱了李世民的计划，无法按时援救洺水，也算是罗士信运气不好吧。
迟到的唐军终于到达了洺水，并且重新占领了城池。在这里唐军将与刘黑闼进行一次会战，或许当时双方并不清楚这将是刘黑闼第一次起兵的终结点。对峙，李世民仍采用坚守不战的方法，准备拖垮刘军。相持了六十余日，时机成熟，双方就在洺水对阵。事前，李世民交待守吏：待我与贼战，乃决之。基于这句话，柏杨先生认为这是一场不知名的残酷的集体谋杀，他在文章说：很明显的，李世民在这场战役，采取的是敌我同归于尽的战术，李世民和高级将领没有危险，因为他们早就脱离战场。他得出这个结论，主要的依据是李世民没有提到半渡而击，也就是说，柏杨先生理解为他的命令含义是在双方混战之际决水。当时看着虽然感觉有股寒气，但也是比较赞同的。可如今看来却有问题了，《资治通鉴》是没提到半渡，但是新旧唐书上却是有的。至于司马光为什么没写半渡的字样，概他以为那是个常识，所以不用写了吧。总之，借助水的冲击力，刘军被冲了个猝不及防。刘黑闼逃到了突厥那里，这样他的第一次起兵，就此告终。
打完刘黑闼，李世民接着进攻徐圆朗。可是不知为什么，李渊突然让李世民回长安一趟。至今其原因我们都不得而知，很多人猜测是李渊生了疑心，可此时父子兄弟间的矛盾并不十分明显，而且这时李渊对李世民还是比较亲近的，疑心之说也不免让人疑心。但除此之外，又能有什么理由呢？在长安说明形势后，李世民又回来接着打徐圆朗。
徐圆朗势力，因此就得在实力之外下点功夫了，比如见风使舵，比如顺风而倒，总之，哪方有利投靠哪方。当听到刘黑闼败，徐圆朗惧，不知道该怎么办好。有人提议让他让位给刘世彻（如此看来当时让位也是很风行的，很多反王竟然都是让位得来的），后来考虑到翟让的下场，徐圆朗便干掉了刚到来的刘世彻。这简直就是一场闹剧。
后来刘黑闼卷土重来，这一次李建成主动请战，于是太子、齐王征讨刘黑闼。第二次刘黑闼又杀唐军一员将，同时也是唐朝一位郡王级别的烈士——李道玄。李道玄本来很勇武，和李世民一起打洛阳的时候连李世民都赞叹不已。李道玄很欣赏李世民那种亲自上阵深入敌军东冲西撞的作风，于是也学着李世民的样子深入敌军。可是他却忘了李世民是全军的统帅，手下有若干忠心不贰的将军，别人不说，单说尉迟敬德就从乱军阵救了李世民好几次，而且接应部队决不敢怠慢堂堂秦王殿下。这些条件李道玄是没有的，而且要命的是他和副将史万宝不合协，结果他深入敌军后史万宝想的却是以他为诱饵诱敌深入。那么李道玄的结果可想而知，但史万宝的盘算也落空了，唐军败。
不过刘黑闼第二次兴兵已无第一次强劲，加之粮尽，何况唐当时基本上已经是天下之主了，刘军兵败是必然。这一次李建成听取了魏征的建议，宽处理了河北叛军，一下子从人心上瓦解了刘军的斗志。当然，所谓的宽是针对别人而言，刘黑闼则是被李建成就地正法了。临刑前，刘黑闼埋怨当初劝他起兵的人，看起来似乎更愿意去种田——但已举过一次兵，那么唐朝肯定不会容他，第二次再举兵也实属无奈。
刘黑闼死后，徐圆朗也宣告失败，遁逃的徐成了唐初又一个被野人杀掉的人。
隋末起兵的英雄豪杰也好，投机倒把者也好，在武德朝基本上已被平定。还有一个梁师都是在贞观朝平定的，他是有突厥的撑腰，才得以勉强苟延残喘。唐当然不容许有这么一个障碍物在眼前，于是李世民利用梁师都的势危援孤的困境，打算招降，但不知是不是因为看到了很多人被李渊杀掉的事实，梁师都很顽强地拒不从命，那就只好打了。唐军打败了来援的突厥兵，包围住了梁师都。我们已经不能知道如果梁师都投降的话李世民会不会饶过他，因为梁师都在被围的时候就被自己的堂兄杀掉了。被自己人杀掉的反王，梁师都算是仅有的。至此唐实现了完全的统一。